自分は出身が新潟市西区で今も実家があります。
高校卒業まで西区で暮らして、その後東京都内で10年生活。
現在は三条市に住んでいて、11年目になります。
皆さんと同じように、どういった暮らしがしたいか
「住みやすい」を決める重要とされるポイントは何なのかによって変わってくるのだと思いますが、
経験上、新潟市西区も三条市もどちらもとても住みやすいです。
東京では品川区に4年、大田区に6年弱住んでいましたが、どちらの住まいもとたも住みやすかったです。
ですが、この4か所における「住みやすい」の尺度は全て一定ではなく、それぞれに優劣が微妙にあるのだとは思います。
ただやはりあまり比べられるものではなく、ただ漠然とどこも全部住みやすかった
と把握、認識しているわけです。
その意味で「住みにくい」の要素を洗い出して
その要素を含まない様に
逆算で住処を考えるのも良いかもしれませんね。

最終的には
「住めば都」は確実にあると思います。
(身もふたもない様な話ですが)

何を重視するかにもよります。生活の利便性を重視するのであれば一番は新潟市になるかと思います。

私自身東京都から新潟市中央区に移住しましたが、東京と比較してもそれ程不便さは感じません。

毎年住みここちランキング＆住みたい街ランキング【新潟県版】が発表されています。今年は新潟市西区、新潟市中央区、聖籠町、田上町、新潟市東区、長岡市が上位に入っています。

個人的には、どのように生活したいかによると思いますが、
ウインタースポーツをしたいのであれば、魚沼、妙高エリア。
生活の便利さでいえば新潟市、長岡市でしょうか。
子どもの教育などを考えると新潟市、長岡市のほうが選択肢が広くはなります。
（通学に不便にならないか、は考えどころですね）

どのような暮らしをしたいか、を考えて、近しい人や実際に住んでいる人に
まずは話を聞いてみるというのはいかがでしょうか。

回答にならないようですが、ぜひ住みやすい街、住みたい街を見つけてください！

私は東京→新潟のIターン経験者です。
三条市と新潟市に住みましたが、都会の生活に慣れている身としては新潟市の便利な環境に慣れやすく、三条市の方が自然も多く密なコミュニティで新しい発見が多かったです。
人によって考え方が違いますので、どんな環境を求めるか是非伺ってみたいです。

どんな生活スタイルをお好みか、に依りますが、県央地域（三条市・燕市・加茂市など）は、県内ならどこへ行くにも近いので、オススメです♪